8.1- Characterization & DNA amplification
8.1.1-PCR
8.1.1.1-General PCR Methods & Guidelines
8.1.1.1.5-Guidelines for Primer Design [Updated by vg93 27Oct2016]
...
.1.1.5.1-Primer Design Checklist [created by vg93 31Oct2016]
...
7-Primer Ordering and Reconstitution SOP [updated 2020-06-01 ram524]
...
9-Ten Things That Can Kill Your PCR Information Sheet [reviewed by mw16 07072016]
...
10-Submitting sequences to GenBank SOP [reviewed by mw16 07072016]
...
...
...
Database Search Protocol.pdf SOP [updated 2020-06-01 ram524]
...
12-rpoB sigB AT Assignment [MW]
...
17-pGEM Ladder for Size Determination of PCR Products SOP [updated by ser15 2020-05-18]
...
18-Gel Electrophoresis of PCR Product SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
...
19-PCR Product Purification and Sanger Sequencing Submission SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
...
20-Sanger Sequencing using BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit SOP [created 2021-01-14 by sjr267]
Sequencing Cost Comparison Supplemental File [created 2020-12-25 by sjr267]
8.1.1.2-Listeria PCR
8.1.1.2.
...
2-
...
Listeria PCRs by Gene Name
...
...
actA PCR SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
...
...
3-Hly a b gene PCR for Listeria monocytogenes SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
...
...
4-inlA ORF and Gene Fragment PCR and Sequencing SOP [reviewed by mw16 07072016]
...
...
...
sigB PCR SOP [updated 2020-01-30 by js2568]
...
...
...
Degenerate sigB PCR SOP [updated 2020-09-05 by ser15]
...
...
16-PCRs For Quadruple sigma factor Mutant.pdf (Yichang and Veronica)
8.1.1
...
.3-Salmonella PCR
...
3.6-InvA colony PCR for Salmonella SOP [updated 2020-04-27 amb629]
...
.3.7-PCR identification of common Salmonella serogroups SOP [reviewed by mw16 07072016]
...
...
determination of H1 and H2-antigens for Salmonella SOP [reviewed by mw16 07072016]
8.1.1.
...
4-PCRs for Other Organisms
...
...
...
...
...
...
...
...
...
Protocol SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
...
...
5-PCR Amplification of Full Length 16s rDNA SOP [updated 18Nov2016 by sjr267]
...
...
...
PCR Amplification of 16s rDNA Internal Region SOP [updated 2020-01-30 by js2568]
...
...
...
...
for Yeast and Mold SOP [updated 2020-06-26 by rle58]
8.1.2-Phenotypic Characterization
[see archive]
8.1.3-RFLP
[see archive]
8.1.
...
4-Southern Blot
[see archive]
8.3-DNA preparation, Purification, & Quantification
8.3.10-Quantification of Purified DNA by NanoDrop SOP [updated 2020-11-20 sh988]
8.3.13-Genomic_DNA_Extraction_Qiagen SOP [updated by ajh22 4/28/16]
8.3.14-HighThroughput_gDNA_Extraction_Qiagen_1_28_15.pdf
8.3.15-Take3_NucleicAcid_96_well_Quantification_01_20_15 Protocol [reviewed by mw16 07072016]
8.3.16-DNA Preparation for Whole Genome Sequencing SOP [updated 27Oct2016 by sh988]
8.3.16.1-Step-by-step checklist for Gram+ bacteria Supplemental file [effective 2Sept2016 ajh22]
8.3.16.2-Step-by-step checklist for Gram- bacteria Supplemental file [effective 13Sept2016 ajh22]
8.3.16.3-CDC MiSeq Nextera XT Library Preparation Reference [reviewed 07Oct2016 by jk2739]
8.3.16.4-Example Nextera Library Sample Preparation Spreadsheet Template [reviewed 07Oct2016 by jk2739]
8.3.18-Preparing Cell Lysates for PCR SOP [updated 2020-05-18 by ser15]
8.4-DNA Sequencing Analysis
Sanger Sequencing
8.4.1-Automated Sequence Editing SOP [updated 2019-10-11 by js2568]
8.4.5-Creating Consensus DNA Sequences using Sequencher SOP [created 2020-04-28 ag67]
8.4.6-rpoB Allelic Type (AT) Assignment SOP [updated 2020-04-28 ag67]
8.4.7-rpoB Database Management SOP [updated 2021-04-01 by ag67]
Whole Genome Sequencing
8.4.2-Quality Control and Assembly SOP [reviewed by jk2739 12/19/2016]
8.4.3-Short Read Submission (SRA) SOP [reviewed by jk2739 12/19/2016]
8.4.4-Assembly submission to NCBI SOP [reviewed by rho2 11/25/2016]
8.5-DNA Recombination & Mutagenesis
8.5.2-Cloning of DNA Fragments Protocol [reviewed 8Aug2016 mw16]
8.5.9-GUS promoter fusions in Listeria monocytogenes Protocol [reviewed 08Aug2016 mw16]
8.5.10-Integration of pPL2 derivatives into L. monocytogenes 10403S Protocol [reviewed 08Aug2016 mw16]
8.5.16-pMJG2 vector map.jpg Plasmid Map [reviewed 08Aug2016 mw16]
8.5.17-pMJG3 vector map.jpg Plasmid Map [reviewed 08Aug2016 mw16]
8.5.18-pMJG4 vector map.jpg Plasmid Map [reviewed 08Aug2016 mw16]
8.5.20-Whole Mutant-Soeing PCR for L. mono SOP [reviewed by bmb29 4/6/2016]
8.5.21-P22 Transduction of Salmonella Protocol [reviewed by ram524 28Jul2017]
8.5.22-Protocol for Lambda Red Recombinase in Salmonella SOP [updated by ram524 2020-06-01]
8.5.23-Gene Deletion Using I-SceI coupled with Lambda Red Recombination in Salmonella SOP [updated by cq87 2021-07-18]
8.6-Microarray
[see archive]
8.7-Protein Methods
8.7.1-Assay for beta-galactosidase activity of B. subtilis transformed with lacZ reporter plasmid Protocol [mw16 checked07072016]
8.7.2-Beta Galactosidase Assay_general Protocol [mw16 checked07072016]
8.7.3-His tagged sigma factor protein purification protocol Protocol [mw16 checked07072016]
8.8-RNA Prep & Analysis
8.8.11-RNA Extraction Using TriReagent SOP [updated by arc326 2020-05-18]
8.8.13-Sybr Green qRT-PCR Protocol [updated by arc326 2020-05-18]
8.8.14-RNA Extraction from Salmonella using Tri-Reagent SOP [updated by arc326 2020-05-18]
8.8.15-RNA extraction from Salmonella using RNeasy Kit SOP [updated 2020-06-01 by ram524]
Training Record
...
8.1.1.2.2.4-inlA ORF and Gene Fragment PCR and Sequencing.pdf
8.1.1.2.2.5-Modified SigB PCR Protocol-Taq Gold 10uM primers.pdf
8.1.1.2.2.6-Multiplex PCR for inlH screening.pdf
8.1.1.2.2.7-Nested hly PCR for Listeria monocytogenes.pdf
8.1.1.2.2.8-Protocol for sequencing actA gene most polymorphic region.pdf
8.1.1.2.2.9-Protocol for Sequencing actA gene region with best discrimination.pdf
8.1.1.2.2.10-Protocol for Sequencing inlA gene region with the best discrimination.pdf
8.1.1.2.2.11-Prs PCR Protocol for Listeria monocytogenes.pdf
8.1.1.2.2.12-PurM PCR Protocol for lineage II Listeria monocytogenes.pdf
8.1.1.2.2.13-PurM PCR Protocol for Listeria monocytogenes.pdf
8.1.1.2.2.14-RibC PCR Protocol for Listeria monocytogenes.pdf
8.1.1.2.2.15-SigB PCR Protocol GoTaq.pdf
8.1.1.3-Salmonella PCR
8.1.1.3.1-fimA PCR and DNA sequencing of Salmonella enterica for 3gene MLST.pdf
8.1.1.3.2-manB PCR and DNA sequencing of Salmonella enterica for 3gene MLST.pdf
8.1.1.3.3-mdh PCR and DNA sequencing of Salmonella enterica for 3gene MLST.pdf
8.1.1.3.4-7 Gene MLST for Salmonella.pdf
8.1.1.3.4.1-7 gene MLST for Salmonella- Primers and PCR.xls
8.1.1.3.4.2-Salmonella 7 gene MLST Template.xls
8.1.1.3.5-PCR detection of the presence or absence of antibiotic resistance genes in Salmonella.pdf
| 8.1.1.1.5-Guidelines for Primer Design | Trainer | Jordan Skeens (example) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Jordan Skeens (example) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 11/02/2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.5.1-Primer Design Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.7-Primer Ordering and Reconstitution | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.9-Ten Things That Can Kill Your PCR | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.10-Submitting sequences to GenBank | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.11-Primer Database Search Protocol.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.17-pGEM Ladder for Size Determination of PCR Products | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.18-Gel Electrophoresis of PCR Product | Trainer | Rachel E | Alex B | Sam B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Zoe | Sam B | Mikayla H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 1/20/21 |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.1.19-PCR Product Purification and Sanger Sequencing Submission | Trainer | Rachel E | Alex B | Sam B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Zoe | Sam B | Mikayla H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 1/21/21 |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.2.2.1-actA PCR | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.2.2.3-Hly a b gene PCR for Listeria monocytogenes | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.2.2.4-inlA ORF and Gene Fragment PCR and Sequencing | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.2.2.5-sigB PCR | Trainer | Alex B | Sam B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Sam B | Mikayla H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.2.2.16-PCRs For Quadruple sigma factor Mutant.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
| 8.1.1.3.6-InvA colony PCR for |
...
| Salmonella | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.3.7-PCR identification of common Salmonella serogroups |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.3.8-PCR determination of H1 and H2-antigens for Salmonella |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
...
| 8.1.1.4.1-E. coli 6-gene multiplex PCR.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.4. |
...
| 4- |
...
| rpoB PCR Protocol | Trainer | Rachel E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Zoe | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 1/20/21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1.1.4. |
...
| 5- |
...
| PCR Amplification of Full Length 16s rDNA | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
...
8.1.2-Phenotypic Characterization
8.1.2.1-Semi-Quantitative Hemolysis Assay for Listeria.pdf
...
| 8.1 |
...
| .1 |
...
| . |
...
| 4 |
...
| .5.1-PCR Amplification of 16s rDNA Internal Region | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.1 |
...
| . |
...
| 1.4. |
...
8.2-DNA Labeling & Modification
8.2.1-3' end labeling of oligonucleotides.pdf
8.2.2-Kinasing and DIG labeling of LCR primer.pdf
8.2.3-Poly-T tailing of oligonucleotides.pdf
8.2.4-Protocol for Fluorescein labeling of oligonucleotides carrying an aminolink.pdf
8.2.5-Protocol for Geneclean (USB).pdf
...
| 6-ITS PCR for Yeast and Mold | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3.10-Quantification of Purified DNA by NanoDrop.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 13- |
...
| Genomic_DNA_ Extraction_Qiagen | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 14-HighThroughput_gDNA_ Extraction_Qiagen _1_28_15.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
| 8.3. |
...
| 15-Take3_NucleicAcid_ 96_well_Quantification _01_20_15 | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 16-DNA Preparation |
...
| for Whole Genome Sequencing | Trainer | Sophia H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Sam B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3 |
...
| .16.1-Step-by-step checklist for Gram+ bacteria | Trainer | Sophia H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Sam B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 16.2-Step-by-step checklist for Gram- bacteria | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 16.3 |
...
| - |
...
| CDC MiSeq Nextera XT Library Preparation | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 16.4-Example Nextera Library Sample Preparation Spreadsheet | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.3. |
...
| 18-Preparing Cell Lysates for PCR | Trainer | Rachel E | Alex B | Sam B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Zoe | Sam B | Mikayla H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | (heat lysis) 1/20/21 |
|
|
...
8.3.11-Single Stranded DNA preparation from M13.pdf
8.3.12-Small-scale phenolchloroform extraction of chromosomal DNA from Listeria monocytogenes.pdf
...
| 8.4.1- |
...
| Automated Sequence Editing | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.4.2- |
...
| Quality Control and Assembly | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.4.3- |
...
| Short Read Submission (SRA) | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.4.4- |
...
| Assembly submission to NCBI | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.4.5- |
...
| Creating Consensus DNA Sequences using Sequencher | Trainer | Alex B | Sam B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Sam B | Mikayla H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.4.6- |
...
| rpoB Allelic Type (AT) Assignment | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
...
| 8. |
...
| 5. |
...
| 2- |
...
| Cloning |
...
| of DNA Fragments | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 5.9-GUS promoter fusions in Listeria monocytogenes |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 5.10-Integration of pPL2 derivatives into L. monocytogenes 10403S |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.5. |
...
8.4.11-Listeria Genomic Alterations.pdf
8.4.12-Overview-Making a mutant in Listeria monocytogenes.pdf
8.4.13-Part II-Making a mutant in Listeria monocytogenes.pdf
8.4.14-Part III-Making a mutant in Listeria monocytogenes.pdf
8.4.15-Part IV-Making a mutant in Listeria monocytogenes.pdf
...
| 16-pMJG2 vector map.jpg | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 5.17-pMJG3 vector map.jpg | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 5.18-pMJG4 vector map.jpg |
...
| Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 5.20-Whole Mutant- |
...
| Soeing PCR for L. mono |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
...
| 8.5. |
...
| 21-P22 Transduction of Salmonella | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.5. |
...
| 22-Protocol for Lambda Red Recombinase in Salmonella | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.7 |
...
8.5.4-Microarray Slide Blocking.pdf
8.6-Protein Methods
...
| .1-Assay for beta-galactosidase activity of B. subtilis transformed with lacZ reporter plasmid |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 7.2-Beta Galactosidase Assay |
...
| _general | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 7.3-His tagged sigma factor protein purification protocol |
...
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8. |
...
| 8. |
...
| 11-RNA Extraction Using TriReagent | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.8.13-Sybr Green qRT-PCR | Trainer | Alexa Cohn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Rory Wang | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 11/19/21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8.8.14_RNAext Salmonella.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
...
8.7.2-Isolation of RNA from Listeria monocytogenes infected mammalian cells.pdf
8.7.3-Preparation of infected tissue culture cells for bacterial RNA collection.pdf
8.7.4-Preperation of Listeria RNA.pdf
8.7.5-RNA extraction, clean-up and storage using Turbo DNase for TaqMan.pdf
8.7.6-RNA Prep with RNeasy Midi Kit instructions.pdf
8.7.7-RNeasy kit total RNA isolation from Listeria monocytogenes with on-column DNase treatment.pdf
8.7.8-RT-PCR for the detection of cytokine mRNA.pdf