5.1 - General Information
5.1.1-Official Lab Manual General Document [updated by ram524 2020nhw6 2023-0908-0517]
5.1.2-Required and Suggested Readings for new students General Document [updated by vg93 2018-02-20]
5.1.3-Exiting Student Checklist General document [updated by ser15 2020-05-18]
5.1.4-Lab Responsibilities General Document [updated by ser15sh988 20202021-0703-1614]
5.1.5-FSL/MQIP SOP Template General Document [updated by nhw6 04/10/2020; use for all SOPs]
5.1.6-Guidelines for the Preparations of Posters.pdf General document [reviewed by cjh263 03/29/2016]
...
5.1.13-PCR and Sequencing Reagent Inventory and Ordering Information General Document [updated by sjr267 2020-01-02]
5.1.14-Laboratory Bench Assignments General document [updated by ram524 2021-03-18]
5.2 - Safety
5.2.1-General safety procedures and handling and disposal of laboratory waste, including biohazard materials General Document [updated by mgg53 2018ag67 2022-0204-1427]
5.2.2-Critical Laboratory Orientation General Document [updated by vg93 2018-02-20]
...
5.3.6-Beckman Coulter 470 pH Meter Use SOP [created by mgg53 2020-08-18]
5.3.7-Special Pipette Inventory [created by sh988]
5.4 - Maintenance
5.4.2-Thermal Cycler Calibration Verification and Temperature Non-Uniformity Testing SOP [updated by js2568 2020-05-19]
Training Record
| 5.1.1-Official Lab Manual | Trainer | Jordan Skeens (example) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Jordan Skeens (example) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 11/02/2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.2-Required and Suggested Readings for new students | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.3-Exiting Student Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.4-Lab Responsibilities | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.5-FSL/MQIP SOP Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.6-Guidelines for the Preparations of Posters.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.7-Mapping Printer Server (Remote Access) | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.8-sigB_Database_ Management.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.9-Preparing Dangerous Goods For Shipping | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.11-Lab Materials Order Form | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.12-Outside Work Report Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.13-PCR and Sequencing Reagent Inventory and Ordering Information | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.1-General safety procedures and handling and disposal of laboratory waste, including biohazard materials | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.2-Critical Laboratory Orientation | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.3-Laboratory Orientation Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.4-Laboratory Cleanliness and Safety Team Weekly Audit Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.2-Spectronic 20Dplus Protocol | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3-Autoplate 5000 Spiral Plater and QCount | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3.1-Spiral Plater Preventive Maintenance | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.4-Thermal Cyclers | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.5-Eddy Jet 2 Spiral Plater and SphereFlash Colony Counter | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.4.2-Thermal Cycler Calibration Verification and Temperature Non-Uniformity Testing | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
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| Trainee | Jordan Skeens (example) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 11/02/2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.2-Required and Suggested Readings for new students | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.3-Exiting Student Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.4-Lab Responsibilities | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.5-FSL/MQIP SOP Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.6-Guidelines for the Preparations of Posters.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.7-Mapping Printer Server (Remote Access) | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.8-sigB_Database_ Management.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.9-Preparing Dangerous Goods For Shipping | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.11-Lab Materials Order Form | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.12-Outside Work Report Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.13-PCR and Sequencing Reagent Inventory and Ordering Information | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.1-General safety procedures and handling and disposal of laboratory waste, including biohazard materials | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.2-Critical Laboratory Orientation | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.3-Laboratory Orientation Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.4-Laboratory Cleanliness and Safety Team Weekly Audit Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.2-Spectronic 20Dplus Protocol | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3-Autoplate 5000 Spiral Plater and QCount | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3.1-Spiral Plater Preventive Maintenance | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.3.4-Thermal Cyclers | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.5-Eddy Jet 2 Spiral Plater and SphereFlash Colony Counter | Trainer | Maria (mms452) (spiral plater only) | Rachel (rle58) (SphereFlash only) | Sam Reichler (sjr267, Sphere Flash only( | Maria (spiral plater only) | Maria (spiral plater only) | Maria (spiral plater only) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Alexis (air43) | Alexis (air43) | Cris (cr634) and Loredana (ld526) | Anthony | Lucas | Juliana | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 2/13/24 | 3/28/24 | 4/10/24 | 6/7/24 | 6/7/24 | 6/7/24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.4.2-Thermal Cycler Calibration Verification and Temperature Non-Uniformity Testing | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date |
5.1 - General Information
5.1.1-Official Lab Manual General Document [updated by ram524 2020-09-05]
5.1.2-Required and Suggested Readings for new students General Document [updated by vg93 2018-02-20]
5.1.3-Exiting Student Checklist General document [updated by ser15 2020-05-18]
5.1.4-Lab Responsibilities General Document [updated by sh988 2021-03-14]
5.1.5-FSL/MQIP SOP Template General Document [updated by nhw6 04/10/2020; use for all SOPs]
5.1.6-Guidelines for the Preparations of Posters.pdf General document [reviewed by cjh263 03/29/2016]
5.1.7-Mapping Printer Server (Remote Access) Protocol [reviewed by ajh22 03/30/2016]
5.1.8-sigB_Database_Management.pdf SOP [in review by Dave Kent]
5.1.9-Preparing Dangerous Goods For Shipping SOP [updated by ser15 2020-05-18]
5.1.11-Lab Materials Order Form Form [updated by mgg53 2020-04-20]
5.1.12-Outside Work Report Template Template [reviewed by mw16 2017-01-03] - Access to this document is restricted to members of the confluence-foodsafety-labmembers group. If you cannot access this document, contact Sam Reichler or Jordan Skeens.
5.1.13-PCR and Sequencing Reagent Inventory and Ordering Information General Document [updated by sjr267 2020-01-02]
5.1.14-Laboratory Bench Assignments General document [updated by ram524 2021-03-18]
5.2 - Safety
5.2.1-General safety procedures and handling and disposal of laboratory waste, including biohazard materials General Document [updated by mgg53 2018-02-14]
5.2.2-Critical Laboratory Orientation General Document [updated by vg93 2018-02-20]
5.2.3-Laboratory Orientation Checklist General Document [updated by nrs13 8/23/2017]
5.2.4-Laboratory Cleanliness and Safety Team Weekly Audit SOP [updated 2020-06-26 by rle58]
5.2.5-Remelting Agar Media SOP [created by ser15 2019-12-12]
5.3 - Equipment Usage
5.3.2-Spectronic 20Dplus Protocol SOP [updated by ser15 2020-05-18]
5.3.3-Autoplate 5000 Spiral Plater and QCount SOP [revised by sjr267 2018-02-20]
5.3.3.1-Spiral Plater Preventive Maintenance Schedule [updated by sjr267 2017-08-11]
5.3.4-Thermal Cyclers SOP [updated by js2568 2020-05-19]
5.3.4.1-Applied Biosystems 2720 Thermal Cycler User Guide Manual [uploaded by sjr267 2017-10-31]
5.3.5-Eddy Jet 2 Spiral Plater and SphereFlash Colony Counter SOP [updated by js2568 2020-05-19]
5.3.6-Beckman Coulter 470 pH Meter Use SOP [created by mgg53 2020-08-18]
5.3.7-Special Pipette Inventory [created by sh988]
5.4 - Maintenance
5.4.2-Thermal Cycler Calibration Verification and Temperature Non-Uniformity Testing SOP [updated by js2568 2020-05-19]
Training Record
| 5.1.1-Official Lab Manual | Trainer | Jordan Skeens (example) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | Jordan Skeens (example) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | 11/02/2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.2-Required and Suggested Readings for new students | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.3-Exiting Student Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.4-Lab Responsibilities | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.5-FSL/MQIP SOP Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.6-Guidelines for the Preparations of Posters.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.7-Mapping Printer Server (Remote Access) | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.8-sigB_Database_ Management.pdf | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.1.9-Preparing Dangerous Goods For Shipping | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.11-Lab Materials Order Form | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.12-Outside Work Report Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.1.13-PCR and Sequencing Reagent Inventory and Ordering Information | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.1-General safety procedures and handling and disposal of laboratory waste, including biohazard materials | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.2-Critical Laboratory Orientation | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.2.3-Laboratory Orientation Checklist | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.2.4-Laboratory Cleanliness and Safety Team Weekly Audit Template | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.3.2-Spectronic 20Dplus Protocol | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3-Autoplate 5000 Spiral Plater and QCount | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.3.1-Spiral Plater Preventive Maintenance | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.3.4-Thermal Cyclers | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Training Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5.3.5-Eddy Jet 2 Spiral Plater and SphereFlash Colony Counter | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Trainee | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5.4.2-Thermal Cycler Calibration Verification and Temperature Non-Uniformity Testing | Trainer | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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